# src/main/resources/core/ngbw.cfg.xml
tool.registry.home=dev

# ###################################################################################
# running sge jobs
# directory must be owned by userid running the web application
# ###################################################################################
# src/main/resources/tool/cipres/tool-registry.cfg.xml:
tool.resource.cluster=CIPRES_CLUSTER
# src/main/resources/tool/cipres/tool-registry.cfg.xml, workspace for SGE jobs on CIPRES_CLUSTER
workspace.cluster=/projects/cipres/w30548/swami-ws/

# ####################################################################################
# running non-sge jobs
# directory must be owned by "bwbatch"
# ####################################################################################
# for tools running with RunServiceApp(): paup, recidcm3-paup, recidcm3-raxml
tool.resource.host=8BALL
host=8ball
# src/main/resources/tool/cipres/tool-registry.cfg.xml, workspace for non-SGE jobs 
workspace=/fs/swami-ws/

# ####################################################################################
# Used for sending job completion email 
# /src/main/resources/tool/[job-html.ftl, job-text.ftl, spring-mail.xml]
# ####################################################################################
portal.url=http://8ball.sdsc.edu/web
portal.name=Swami - The Next Generation Biology Workbench 
job.email.from=Swami Portal Test<lcchan@sdsc.edu>
job.email.enable=false

# ####################################################################################
# Database connection info that will be used in resource filtering of  
#    /src/main/resources/database/database.properties 
# See Readme.txt for explanation of why database.username and database.password
# aren't here. 
# ####################################################################################
database.url=jdbc:mysql://mysql.sdsc.edu:3312/ngbwtest
database.maxPoolSize=15
database.minPoolSize=3
database.debugUnreturnedConnectionStackTraces=true
database.unreturnedConnectionTimeout=120
database.fileRoot=/archive/science/ngbt/db_documents/ngbw_test
database.tempFileRoot=/archive/science/ngbt/db_documents/temp

process_worker_command=
# process_worker_logs should be the same directory as ngbw.logs!
process_worker_logs=