# src/main/resources/core/ngbw.cfg.xml tool.registry.home=cipres # ################################################################################### # running sge jobs # directory must be owned by userid running the web application # ################################################################################### # src/main/resources/tool/cipres/tool-registry.cfg.xml: tool.resource.cluster=CIPRES_CLUSTER # src/main/resources/tool/cipres/tool-registry.cfg.xml, workspace for SGE jobs on CIPRES_CLUSTER workspace.cluster=/projects/cipres/portal2test/workspace/ # Terri uses this value for her development testing (on 8ball) of sge cluster tools # workspace.cluster=/projects/cipres/terri/ngbw/test_workspace/ # #################################################################################### # running non-sge jobs # directory must be owned by "bwbatch" # #################################################################################### # for tools running with RunServiceApp(): paup, recidcm3-paup, recidcm3-raxml tool.resource.host=8BALL host=8ball # src/main/resources/tool/cipres/tool-registry.cfg.xml, workspace for non-SGE jobs workspace=/scratch/s1/portal2test/workspace/ # Terri uses this value for her development testing i(on 8ball) of non-sge tools (i.e. old cipres fw) # workspace=/fs/swami-ws/ # #################################################################################### # Used for sending job completion email # /src/main/resources/tool/[job-html.ftl, job-text.ftl, spring-mail.xml] # #################################################################################### portal.url=http://localhost/portal2 portal.name=Cipres Portal Dev job.email.from=Cipres Web Portal job.email.enable=true # #################################################################################### # Database connection info that will be used in resource filtering of # /src/main/resources/database/database.properties # See Readme.txt for explanation of why database.username and database.password # aren't here. # #################################################################################### database.url=jdbc:mysql://mysql.sdsc.edu:3312/ngbwtest database.maxPoolSize=5 database.minPoolSize=1 database.debugUnreturnedConnectionStackTraces=true database.unreturnedConnectionTimeout=120 process_worker_command=process_worker_run # process_worker_logs should be the same directory as ngbw.logs! process_worker_logs=/tmp