blastn blastn 2.2.4 [Aug-26-2002] ~Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, ~Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), ~"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search~programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. gadfly3dna lcl|QUERY EP(2)0541 AQ074120 inserted at base 431 5' end of P element Inverse PCR 438 10 1 -3 5 2 D 1 1 lcl|2R 2R [1,20302755] 2R 20302755 1 739.912 373 0 412 1 16734615 16735026 1 -1 402 402 412 CTACAAACCAACAGATAGCAATTCGCCCTGCGTTGCCCAACGACATAGCCTGCTACGAAAAAACGACACACTAACGCGTTCCGTTGGAAGGTGTGCGGGATTTTTTATCACTGGCACGTGTGACANCTGTCACATAGGGTTATTCCTTTCAATCGAAGTCACTGTATTGGGAAACTGTGATTTGAGTTAGTTCGAAAACAGAGTGAATCTGTATTGCTAGGTTGATTTGTTTTCTGGAACTGTACTTATTTATCACTTAATCAGCCAAATTACTTTATATGCTTGTCAATGGTTTTAATATAATTTAAAAATTGCAAATTTTAAATGCAACATGTTAATTATCAGTATCAGTGATAAATATTTTAGCAACATTGTGAGTATTTATTGCTTTAGCATATTTAAGATTTTGAAT CTACAAACCAACAGACAGCGATTCGCCCTGCGTTGCCCAACGACATAGCCTGCTACGAAAAAACGACACACTAACGCGTTCCGTTGGAAGGTGTGCGGGATTTTTTATCACTGGCACGTGTGACAGCTGTCACATAGGGTTATTCCTTTCAATCGAAGTCACTGTATTGGGAAACTGTGATTTGAGTTGGTTCGGAATCAGAGTGAATCTGTATTGCTAGGTTGATTTGTTTTCTGGAACTGTACTTATTTATCACTTAATCAGCCAAATTACTTTATATGTTTGTCAATGGCTTTAATATAATTTAAAAATTGCAAATTTTAAATGCTACATGTTAATTATCAGTATCAGTGATAAATATGTTAGCAACATTGTGAGTATTTATTGCTTTAGCATATTTAAGATTTTGAAT ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 2 36.1753 18 0.672129 87 104 3360561 3360578 1 1 18 18 18 ATTTAAAATTTGCAATTT ATTTAAAATTTGCAATTT |||||||||||||||||| 3 36.1753 18 0.672129 111 94 9205880 9205897 1 -1 18 18 18 AATTTAAAAATTGCAAAT AATTTAAAAATTGCAAAT |||||||||||||||||| 4 36.1753 18 0.672129 103 120 5919254 5919271 1 1 18 18 18 TTTTAAATTATATTAAAA TTTTAAATTATATTAAAA |||||||||||||||||| 5 34.193 17 2.65584 151 135 5402994 5403010 1 -1 17 17 17 CAGCCAAATTACTTTAT CAGCCAAATTACTTTAT ||||||||||||||||| 6 34.193 17 2.65584 430 414 877479 877495 1 -1 17 17 17 TTATGTTATTTCATCAT TTATGTTATTTCATCAT ||||||||||||||||| 2 lcl|3R 3R [1,27890790] 3R 27890790 1 38.1577 19 0.1701 322 304 7102079 7102097 1 -1 19 19 19 GTGTGCGGGATTTTTTATC GTGTGCGGGATTTTTTATC ||||||||||||||||||| 2 38.1577 19 0.1701 89 111 13594916 13594938 1 1 22 22 23 TTAAAATTTGCAATTTTTAAATT TTAAAATTTGCAATTTTCAAATT ||||||||||||||||| ||||| 3 38.1577 19 0.1701 102 120 17776753 17776771 1 1 19 19 19 TTTTTAAATTATATTAAAA TTTTTAAATTATATTAAAA ||||||||||||||||||| 4 36.1753 18 0.672129 101 118 19026793 19026810 1 1 18 18 18 ATTTTTAAATTATATTAA ATTTTTAAATTATATTAA |||||||||||||||||| 5 34.193 17 2.65584 91 107 10033606 10033622 1 1 17 17 17 AAAATTTGCAATTTTTA AAAATTTGCAATTTTTA ||||||||||||||||| 6 34.193 17 2.65584 276 260 2009716 2009732 1 -1 17 17 17 GGGTTATTCCTTTCAAT GGGTTATTCCTTTCAAT ||||||||||||||||| 3 lcl|X X [1,21666217] X 21666217 1 36.1753 18 0.672129 120 103 8489563 8489580 1 -1 18 18 18 TTTTAATATAATTTAAAA TTTTAATATAATTTAAAA |||||||||||||||||| 2 34.193 17 2.65584 89 105 15524963 15524979 1 1 17 17 17 TTAAAATTTGCAATTTT TTAAAATTTGCAATTTT ||||||||||||||||| 3 34.193 17 2.65584 42 58 4923308 4923324 1 1 17 17 17 TGTTGCTAAAATATTTA TGTTGCTAAAATATTTA ||||||||||||||||| 4 34.193 17 2.65584 96 112 14954722 14954738 1 1 17 17 17 TTGCAATTTTTAAATTA TTGCAATTTTTAAATTA ||||||||||||||||| 5 34.193 17 2.65584 20 36 1817049 1817065 1 1 17 17 17 CTAAAGCAATAAATACT CTAAAGCAATAAATACT ||||||||||||||||| 6 34.193 17 2.65584 134 118 5435795 5435811 1 -1 17 17 17 ATGCTTGTCAATGGTTT ATGCTTGTCAATGGTTT ||||||||||||||||| 7 34.193 17 2.65584 111 91 12703981 12704001 1 -1 20 20 21 AATTTAAAAATTGCAAATTTT AATTTAAAATTTGCAAATTTT ||||||||| ||||||||||| 8 34.193 17 2.65584 126 142 2108254 2108270 1 1 17 17 17 GACAAGCATATAAAGTA GACAAGCATATAAAGTA ||||||||||||||||| 9 34.193 17 2.65584 30 14 15494256 15494272 1 -1 17 17 17 TATTGCTTTAGCATATT TATTGCTTTAGCATATT ||||||||||||||||| 4 lcl|2L 2L [1,22217931] 2L 22217931 1 36.1753 18 0.672129 123 102 13912497 13912518 1 -1 21 21 22 TGGTTTTAATATAATTTAAAAA TGGTTTTAATATAATTTCAAAA ||||||||||||||||| |||| 2 36.1753 18 0.672129 91 112 4981995 4982016 1 1 21 21 22 AAAATTTGCAATTTTTAAATTA AAAATTTGAAATTTTTAAATTA |||||||| ||||||||||||| 3 36.1753 18 0.672129 123 140 6095071 6095088 1 1 18 18 18 ATTGACAAGCATATAAAG ATTGACAAGCATATAAAG |||||||||||||||||| 4 34.193 17 2.65584 102 86 2958314 2958330 1 -1 17 17 17 ATTGCAAATTTTAAATG ATTGCAAATTTTAAATG ||||||||||||||||| 5 34.193 17 2.65584 154 174 6543856 6543876 1 1 20 20 21 TAAGTGATAAATAAGTACAGT TAAGTAATAAATAAGTACAGT ||||| ||||||||||||||| 6 34.193 17 2.65584 100 120 16447953 16447973 1 1 20 20 21 AATTTTTAAATTATATTAAAA AATTTTCAAATTATATTAAAA |||||| |||||||||||||| 7 34.193 17 2.65584 101 117 16545849 16545865 1 1 17 17 17 ATTTTTAAATTATATTA ATTTTTAAATTATATTA ||||||||||||||||| 5 lcl|3L 3L [1,23352213] 3L 23352213 1 34.193 17 2.65584 191 175 11749270 11749286 1 -1 17 17 17 TTGATTTGTTTTCTGGA TTGATTTGTTTTCTGGA ||||||||||||||||| 2 34.193 17 2.65584 41 57 18141360 18141376 1 1 17 17 17 ATGTTGCTAAAATATTT ATGTTGCTAAAATATTT ||||||||||||||||| 3 34.193 17 2.65584 13 29 21505454 21505470 1 1 17 17 17 AAATATGCTAAAGCAAT AAATATGCTAAAGCAAT ||||||||||||||||| 4 34.193 17 2.65584 21 5 3858109 3858125 1 -1 17 17 17 AGCATATTTAAGATTTT AGCATATTTAAGATTTT ||||||||||||||||| 5 34.193 17 2.65584 103 119 4533465 4533481 1 1 17 17 17 TTTTAAATTATATTAAA TTTTAAATTATATTAAA ||||||||||||||||| 6 34.193 17 2.65584 117 101 10630771 10630787 1 -1 17 17 17 TAATATAATTTAAAAAT TAATATAATTTAAAAAT ||||||||||||||||| 7 124181667 0 5.21562e+10 0.710605 1.37407 1.30725